Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GASTP01350 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GASTP01350 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GASTP01350 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GASTP01350 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GASTP01350 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GASTP01350 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GASTP01350 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GASTP01350 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GASTP01350 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GASTP01350 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GASTP01350 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GASTP01350 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms