Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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ZBED1O96006 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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ZBED1O96006 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED1O96006 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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