Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms