Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OFD1O75665 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OFD1O75665 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OFD1O75665 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OFD1O75665 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OFD1O75665 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
OFD1O75665 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OFD1O75665 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OFD1O75665 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OFD1O75665 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OFD1O75665 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms