Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45BO75293 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45BO75293 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms