Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms