Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
N4BP1O75113 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms