Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms