Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LANCL1O43813 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms