Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms