Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPATO15228 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPATO15228 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPATO15228 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPATO15228 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
GNPATO15228 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms