Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUX2O14529 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CUX2O14529 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CUX2O14529 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CUX2O14529 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CUX2O14529 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CUX2O14529 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CUX2O14529 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CUX2O14529 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CUX2O14529 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CUX2O14529 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CUX2O14529 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CUX2O14529 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CUX2O14529 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CUX2O14529 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CUX2O14529 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CUX2O14529 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CUX2O14529 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CUX2O14529 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CUX2O14529 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CUX2O14529 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUX2O14529 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CUX2O14529 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CUX2O14529 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CUX2O14529 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CUX2O14529 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CUX2O14529 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CUX2O14529 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
CUX2O14529 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CUX2O14529 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CUX2O14529 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CUX2O14529 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CUX2O14529 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CUX2O14529 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CUX2O14529 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CUX2O14529 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUX2O14529 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms