Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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