Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms