Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms