Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM1B2RUZ4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms