Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPBD1B2RD01 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms