Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC69A6NI79 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms