Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6L3A6NEY3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms