Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms