Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC01226-208ENST00000640623 5019 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 FHL2-207ENST00000409177 4881 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PBRM1-201ENST00000296302 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF473-202ENST00000391821 4715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DHX8-201ENST00000262415 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 THAP12P6-201ENST00000431978 2310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ALPK1-203ENST00000458497 5410 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms