Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 HERC2P2-201ENST00000613386 5181 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 FBXW7-204ENST00000393956 1735 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CCDC174-201ENST00000303688 2714 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ADD2-205ENST00000413157 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RASGRP1-206ENST00000558164 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNA5SP298-201ENST00000364991 111 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 IGHV1-58-201ENST00000390628 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SPACA3-203ENST00000394638 508 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 UQCR10-202ENST00000401406 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP000350.3-201ENST00000440099 289 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RPS10P5-201ENST00000492704 531 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC078867.1-201ENST00000503372 1118 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC127070.4-201ENST00000536775 385 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC01405-204ENST00000553177 524 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DNM1P32-201ENST00000566124 544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PPCDC-210ENST00000568649 926 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RN7SL138P-201ENST00000577405 287 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP005328.1-202ENST00000580781 776 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC087645.3-201ENST00000624708 587 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PGAM1P5-203ENST00000626376 313 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZNF460-201ENST00000360338 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NLRP3-205ENST00000391827 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PRAMENP-202ENST00000419303 1869 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TRIT1-203ENST00000441669 1851 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC01588-204ENST00000530176 2444 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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HOXD11P31277 ARMC8-217ENST00000481646 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NRP1-206ENST00000374867 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 IER3IP1-201ENST00000256433 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 POP4-202ENST00000585603 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TMEM215-201ENST00000342743 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MARK3-207ENST00000553942 2298 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SLC25A19-203ENST00000402418 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ANKRD46-206ENST00000520552 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DDX24-210ENST00000622786 1730 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SIGLEC10-202ENST00000353836 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 VRK3-223ENST00000601341 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SEMA4A-204ENST00000368285 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CYP11B1-201ENST00000292427 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 S1PR3-201ENST00000358157 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CLDN1-201ENST00000295522 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RAD52-202ENST00000358495 2710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PRICKLE1-215ENST00000640055 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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