Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ARID3CA6NKF2 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms