Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms