Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR6

KRTAP3-3, Keratin-associated protein 3-3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF317P1-201ENST00000521453 1027 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AP003532.1-201ENST00000529936 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 USP2-AS1-203ENST00000530002 764 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC5A4P1-201ENST00000532944 612 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FGF11-205ENST00000575398 990 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TMEM205-204ENST00000586218 593 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SNRPD2-204ENST00000587367 596 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC093107.2-201ENST00000603668 445 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC015660.4-201ENST00000621331 621 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC074043.1-201ENST00000483126 1776 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GGA3-205ENST00000578348 2251 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 C3orf67-206ENST00000472469 4108 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SIDT2-220ENST00000628876 2609 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GNL3L-202ENST00000360845 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LRRC10-201ENST00000361484 2599 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BCL11A-202ENST00000356842 3959 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 EPC1-201ENST00000263062 2913 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 CISD1-201ENST00000333926 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 ZSWIM5P2-201ENST00000420212 2038 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 CTAGE16P-201ENST00000435601 2412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 FITM2-201ENST00000396825 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 CARD14-201ENST00000344227 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 GINS3-202ENST00000328514 1932 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 SERPINA5-201ENST00000329597 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 AC010867.1-201ENST00000558038 2289 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 IFT80-201ENST00000326448 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC35F6-201ENST00000344420 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 CACNB2-208ENST00000377331 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 C4orf3-201ENST00000399075 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 APOL1-202ENST00000397278 2918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 TTC17-201ENST00000039989 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 ZC3HC1-209ENST00000481503 1741 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 CDHR4-202ENST00000412678 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 AP000552.1-201ENST00000447720 3215 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC7A7-202ENST00000397528 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC7A7-203ENST00000397529 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 ACTG2-202ENST00000409624 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 HMGCLL1-206ENST00000428842 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 SEMA6A-205ENST00000503865 1678 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 AP1S2-202ENST00000380291 3492 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC01446-201ENST00000380970 3484 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 NLRP10-201ENST00000328600 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP3-3Q9BYR6 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms