Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 ARID1B-210ENST00000635849 5830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPEGQ15772 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SPEGQ15772 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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