Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms