Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR6

KRTAP3-3, Keratin-associated protein 3-3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-3Q9BYR6 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC015849.1-201ENST00000605548 662 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CHRNB1-202ENST00000536404 1623 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC22A8-210ENST00000545207 1622 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ASB9-203ENST00000380488 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 EIF4BP7-201ENST00000432307 1813 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BMPR1B-208ENST00000515059 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 IL20RB-201ENST00000329582 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BCL6-206ENST00000450123 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF728-201ENST00000594710 2015 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 Z97200.1-201ENST00000606154 2045 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TAOK3-209ENST00000537952 2147 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 NR2F2-203ENST00000421109 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ALDH1L1-AS2-202ENST00000500525 2236 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CWH43-204ENST00000513409 2390 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TMEM108-AS1-202ENST00000505721 2427 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 COG2-202ENST00000366669 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF438-204ENST00000413025 3106 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SGK1-204ENST00000367858 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 STRIP1-201ENST00000369795 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC26A8-208ENST00000490799 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 WNT4-201ENST00000290167 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PSMG3-AS1-203ENST00000457484 3839 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MIER1-207ENST00000371018 3875 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PPFIA2-227ENST00000552948 3976 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RASSF8-203ENST00000405154 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RBM7-203ENST00000540163 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DPY19L2P2-204ENST00000438364 3947 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PTPN2-201ENST00000309660 3467 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZFAND4-202ENST00000344646 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DHRS4-AS1-205ENST00000556379 2852 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ARHGAP40-202ENST00000373345 2841 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MX1-201ENST00000288383 2733 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CCDC174-201ENST00000303688 2714 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RAD52-204ENST00000430095 2366 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF98-201ENST00000357774 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SH3GL3-201ENST00000324537 2012 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF57-203ENST00000523428 1774 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 INTS14-215ENST00000569491 1797 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PRAMEF6-201ENST00000376189 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PRAMEF6-202ENST00000415464 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PRAMEF5-201ENST00000622421 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BAG5-203ENST00000445922 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SEC22C-201ENST00000264454 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms