Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC005099.1-201ENST00000442083 610 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CREM-224ENST00000468236 582 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC01094-206ENST00000514130 594 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL355922.4-201ENST00000555642 449 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC01721-201ENST00000457274 2376 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 NPY6R-201ENST00000503807 1112 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms