Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms