Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPREP23469 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPREP23469 IL18R1-201ENST00000233957 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPREP23469 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SLAMF7-211ENST00000621377 2608 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SRL-201ENST00000399609 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LINC02245-201ENST00000449259 2928 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 OR4P4-202ENST00000641760 2086 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SMCP-201ENST00000368765 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SNRK-AS1-201ENST00000422681 750 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CELF2-AS2-202ENST00000432370 1227 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PTPREP23469 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PTPREP23469 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PTPREP23469 TOM1L1-203ENST00000536554 1522 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PTPREP23469 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 AC091132.4-201ENST00000587960 2262 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 EEF1A1P27-201ENST00000429983 1135 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 OR2M3-201ENST00000456743 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 NUTF2P4-201ENST00000458353 381 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC004801.2-201ENST00000468202 779 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AP000757.2-201ENST00000531850 557 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
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