Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PPP1R3B-201ENST00000310455 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 TACR1-201ENST00000305249 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ZNF264-201ENST00000263095 12163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PTCHD1-201ENST00000379361 13714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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