Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
NFIXQ14938 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms