Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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