Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL592504.1-201ENST00000605319 439 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.1 ms