Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AP001042.1-201ENST00000416842 487 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL049734.1-201ENST00000422384 608 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 PIGCP2-201ENST00000433617 835 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 OR5M13P-201ENST00000433944 937 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC016734.1-201ENST00000436998 654 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC005099.1-201ENST00000442083 610 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 IFNA22P-201ENST00000458710 570 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC114964.1-201ENST00000502306 1111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC034232.2-201ENST00000511579 917 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 GZMB-205ENST00000526004 819 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC123788.1-201ENST00000526922 783 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL162311.2-201ENST00000550416 709 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL132712.1-201ENST00000555967 582 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MIR4682-201ENST00000580643 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL844908.1-201ENST00000609953 652 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CGA-202ENST00000610310 615 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.115-201ENST00000619303 284 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC01002-216ENST00000632351 572 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL590644.1-202ENST00000634972 590 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MIR3120-201ENST00000636555 81 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC127459.1-201ENST00000563129 2768 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 EEF1A1P10-201ENST00000475365 1390 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MAPK10-325ENST00000641537 2623 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MAPK10-210ENST00000449047 2382 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 TMEM144-216ENST00000514558 3699 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 SLC9B2-201ENST00000362026 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC110769.2-201ENST00000602760 1548 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 TSC22D1-201ENST00000261489 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ZMAT4-201ENST00000297737 2466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 USP30-203ENST00000392784 2483 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC011330.1-201ENST00000510070 3235 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CCDC25-201ENST00000356537 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 OR9K2-201ENST00000305377 1122 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms