Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FAM187BQ17R55 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms