Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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CHD4Q14839 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CHD4Q14839 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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CHD4Q14839 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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CHD4Q14839 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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