Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AGXT2-206ENST00000618015 2181 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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