Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQE9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQE9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQE9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQE9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQE9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQE9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQE9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQE9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQE9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQE9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQE9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms