Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms