Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KPTNQ9Y664 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KPTNQ9Y664 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KPTNQ9Y664 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KPTNQ9Y664 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KPTNQ9Y664 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KPTNQ9Y664 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KPTNQ9Y664 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KPTNQ9Y664 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms