Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms