Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms