Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms