Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms