Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGTPBP1Q9UPW5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms