Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1BQ9UPS6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms