Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRQQ9UN88 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRQQ9UN88 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms