Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms